Les agents de l'UNCLE Solo et Kuryakin sont chargés d'enquêter sur les détournements en mer, où des personnes sont enlevées à bord de navires par un navire battant pavillon pirate. Le pirate principal, le capitaine Shark, pense que le monde sera bientôt inévitablement détruit par la troisième guerre mondiale et considère son navire comme une arche de Noé des temps modernes.