Sera invite Conan chez elle pour le jauger avec son étrange colocataire. Cependant, Conan n'arrive pas seul mais accompagné de Ran et Sonoko. Ils décident alors de se rendre à la piscine de l'hôtel où la fille du propriétaire, Nagami, fait un caprice. S'apercevant alors qu'elle a perdu son collier, elle fait évacuer tous les clients pour le chercher, seule, dans l'eau. Lorsque plusieurs heures plus tard, elle est retrouvée, noyée, au fond de la piscine, l'enquête commence pour Conan et Sera. Pendant ce temps, Ran semble se souvenir de quelque chose.