Trois jeunes filles ayant l'âge d'aller au lycée arrivent dans les vestiges d'une ancienne capitale du Japon. La ville qui a été dévastée il y a plusieurs années cache probablement des survivants. C'est à ces jeunes filles de les retrouver pour les évacuer. En effet, des particules nocives pour l'être humain se déversent sur la ville. Pourtant, les trois adolescentes ne portent aucun équipement de sécurité quelconque... Elles sont le fruit d'une expérience génétique visant à renforcer leurs défenses face à ces particules...