Alors qu'ils viennent juste de terminer une mission à Washington D. C., Eliot reçoit un appel d'une ancienne connaissance et comprend que quelque chose de grave se prépare. Après avoir sauvé la vie d'une jeune femme et contacté son vieil ami le colonel Michael Vance, Eliot, Hardison et Parker se retrouvent à traquer dans la ville un homme qui a récupéré une souche du virus de la grippe de 1918 et qui compte le relâcher dans la ville, faisant des millions de morts.