A világunk bomlásának jelei egyre erősödnek. A lakosság egyre több megmagyarázhatatlan természeti jelenségekkel szembesül, melynek okozója az a szerkezet, melynek darabjait Walterék megtalálták és összerakták. Csak míg eddig a tudós csapat abban a hitben élt, hogy egyedsül Peter tudja működésbe hozni, a gép egyszer csak beindult, és vele az események is felgyorsultak. Nina Sharp szerint csak egy ember segíthet, a titokzatos Sam Weiss, aki már William Bell idején is sokat segített a tudósoknak.