A Csillagkapu 9. ékzárát tanulmányozó titkos kutatócsoport bázisát megtámadják, így a csapat kénytelen a titokzatos kapun átkelve menekülni. A túlélők egy ősrégi űrhajóra, a Destiny-re kerülnek, amely azonban mindenki megdöbbenésére több millió fényév távolságra lebeg a Földtől. Miután Dr. Nicholas Rush (Robert Carlyle) kapcsolatba lép az otthoniakkal, megdöbbentő hírt közöl a többiekkel: a Destinyt az Ősök tervezték, útja megváltoztathatatlan, mivel előre beprogramozták. Nincs menekvés, nincs visszaút a Földre. A hírt azonban nem mindenki fogadja el...