Leonardo continua le sue ricerche sul libro delle foglie, ma resta deluso dal mancato successo dei suoi progetti sulle macchine da guerra, a causa di uno screzio coi Medici. Questo non impedisce al papa di rendersi conto delle grandi abilità del geniale inventore fiorentino. Il nipote del pontefice rapisce Nico per scoprire cosa Leonardo ha scoperto con l'autopsia del turco. Alla fine Leonardo prova ai Medici la sua lealtà e il suo genio.