Os adolescentes Augie, Skip e April libertaram acidentalmente um fantasma de 200 anos chamado Jonathan Wellington Muddlemore, juntamente com o seu gato fantasmagórico, Boo, de um relógio de avô em que tinham ficado presos, quando um deles marcou os ponteiros do relógio para a meia-noite. Mudsy e Boo se juntaram aos adolescentes e seu cachorro em um buggy chamado Looney Duney, resolvendo mistérios à maneira de Scooby Doo Where Are You! Logo, a série começou a desenvolver sua própria identidade, fazendo com que os personagens conhecessem criminosos reais em vez de bandidos com máscaras, e a maioria dos episódios também teria moral neles. Nos quadrinhos, os personagens encontraram outros fantasmas além de Mudsy e Boo.