Shinichi Kudo är en av Japans mest kända detektiver och en stor beundrare av Sherlock Holmes. Under ett spaningsarbete blir Shinichi överfallen av några mystiska män som tvingar i honom ett gift. Ett gift som krymper hans kropp till ett barns! I en sexårings kropp, med det tagna namnet Conan Edogawa, letar Shinichi efter sina förövare. Samtidigt fortsätter han att med sin skarpa hjärna lösa kniviga mordfall...