När två arbetare håller på att frakta bort tunnor från ett lager i en hamn så råkar de tappa en av tunnorna. Och det visar sig då att den innehåller en död kropp av en sjöman som verkar ha arbetat på en ubåt. Så NCIS måste utreda vem personen är och om den har mördats, så att en annan person ska kunna infiltrera en av marinens ubåtar.