L'Indipendence Inn chiude definitivamente a causa dell'incendio. Lorelai dice a Rory che non può comprare il Dragonfly perché i soldi rimasti dell'assegno di 75.000 dollari serviranno per Yale dato che hanno perso la borsa di studio. Rory decide allora di chiedere ai nonni di pagarle l'università, in cambio tornerà a cena il venerdì sera e dopo la laurea restituirà i soldi. Lorelai e Sookie possono quindi comprare la locanda. Rory si diploma e riceve una chiamata. Rory capisce che è Jess e dopo avergli detto di averlo amato chiude definitivamente la sua storia con lui. Le Gilmore sono pronte per il loro viaggio in Europa. Luke per l'estate ha in programma una crociera con Nicole ma sogna che Lorelai gli chieda di non fidanzarsi.